MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 plasmid pSaa6159

Total Repeats: 395

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017339	AAT	2	6	4	9	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551480
2	NC_017339	ATT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
3	NC_017339	A	6	6	46	51	100 %	0 %	0 %	0 %	384551480
4	NC_017339	TTA	2	6	62	67	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
5	NC_017339	TAT	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
6	NC_017339	ACA	2	6	122	127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551480
7	NC_017339	T	6	6	172	177	0 %	100 %	0 %	0 %	384551480
8	NC_017339	AT	3	6	189	194	50 %	50 %	0 %	0 %	384551480
9	NC_017339	ATG	2	6	206	211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551480
10	NC_017339	GGTTG	2	10	265	274	0 %	40 %	60 %	0 %	384551480
11	NC_017339	ATTT	2	8	292	299	25 %	75 %	0 %	0 %	384551480
12	NC_017339	TTA	2	6	300	305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
13	NC_017339	AT	3	6	326	331	50 %	50 %	0 %	0 %	384551480
14	NC_017339	A	6	6	340	345	100 %	0 %	0 %	0 %	384551480
15	NC_017339	AAAG	2	8	363	370	75 %	0 %	25 %	0 %	384551480
16	NC_017339	TAT	2	6	2282	2287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
17	NC_017339	GTT	2	6	2298	2303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551481
18	NC_017339	GCT	3	9	2304	2312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551481
19	NC_017339	CAG	2	6	2329	2334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551481
20	NC_017339	TTA	2	6	2340	2345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
21	NC_017339	TTA	2	6	2352	2357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
22	NC_017339	T	6	6	2361	2366	0 %	100 %	0 %	0 %	384551481
23	NC_017339	TAT	2	6	2426	2431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
24	NC_017339	TTAG	2	8	2439	2446	25 %	50 %	25 %	0 %	384551481
25	NC_017339	ATG	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551481
26	NC_017339	AG	3	6	2566	2571	50 %	0 %	50 %	0 %	384551481
27	NC_017339	A	6	6	2574	2579	100 %	0 %	0 %	0 %	384551481
28	NC_017339	TGAA	2	8	2584	2591	50 %	25 %	25 %	0 %	384551481
29	NC_017339	ATA	2	6	2653	2658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551481
30	NC_017339	TTAC	2	8	2706	2713	25 %	50 %	0 %	25 %	384551481
31	NC_017339	TAATTT	2	12	2728	2739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
32	NC_017339	TCT	2	6	2740	2745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551481
33	NC_017339	TTG	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551481
34	NC_017339	TA	3	6	2832	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	384551481
35	NC_017339	TTTA	2	8	2846	2853	25 %	75 %	0 %	0 %	384551481
36	NC_017339	TTA	3	9	2851	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
37	NC_017339	TGTGA	2	10	2940	2949	20 %	40 %	40 %	0 %	384551482
38	NC_017339	T	6	6	2987	2992	0 %	100 %	0 %	0 %	384551482
39	NC_017339	AGA	2	6	2993	2998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551482
40	NC_017339	A	6	6	3031	3036	100 %	0 %	0 %	0 %	384551482
41	NC_017339	TGA	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551482
42	NC_017339	GAA	2	6	3047	3052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551482
43	NC_017339	AGA	2	6	3080	3085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551482
44	NC_017339	TG	3	6	3091	3096	0 %	50 %	50 %	0 %	384551482
45	NC_017339	CAT	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551482
46	NC_017339	TA	3	6	3160	3165	50 %	50 %	0 %	0 %	384551482
47	NC_017339	ATT	2	6	3208	3213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551482
48	NC_017339	TTA	2	6	3214	3219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551482
49	NC_017339	AG	3	6	3234	3239	50 %	0 %	50 %	0 %	384551482
50	NC_017339	AGG	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384551482
51	NC_017339	AT	3	6	3738	3743	50 %	50 %	0 %	0 %	384551483
52	NC_017339	TCA	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551483
53	NC_017339	AGA	2	6	3801	3806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551483
54	NC_017339	AGT	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551483
55	NC_017339	TAA	2	6	3840	3845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
56	NC_017339	CAG	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551483
57	NC_017339	AGT	2	6	3877	3882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551483
58	NC_017339	ATA	2	6	3898	3903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
59	NC_017339	ATT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551483
60	NC_017339	GAA	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551483
61	NC_017339	TA	3	6	4032	4037	50 %	50 %	0 %	0 %	384551483
62	NC_017339	A	6	6	4084	4089	100 %	0 %	0 %	0 %	384551483
63	NC_017339	AAAGT	2	10	4163	4172	60 %	20 %	20 %	0 %	384551483
64	NC_017339	TGGA	2	8	4221	4228	25 %	25 %	50 %	0 %	384551483
65	NC_017339	A	7	7	4257	4263	100 %	0 %	0 %	0 %	384551483
66	NC_017339	A	7	7	4266	4272	100 %	0 %	0 %	0 %	384551483
67	NC_017339	T	6	6	4308	4313	0 %	100 %	0 %	0 %	384551483
68	NC_017339	AGA	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551483
69	NC_017339	ATGT	2	8	4339	4346	25 %	50 %	25 %	0 %	384551483
70	NC_017339	CA	3	6	4366	4371	50 %	0 %	0 %	50 %	384551483
71	NC_017339	TGA	2	6	4377	4382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551483
72	NC_017339	AAT	2	6	4426	4431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
73	NC_017339	TCAT	2	8	4441	4448	25 %	50 %	0 %	25 %	384551483
74	NC_017339	A	6	6	4491	4496	100 %	0 %	0 %	0 %	384551483
75	NC_017339	TTAA	2	8	4507	4514	50 %	50 %	0 %	0 %	384551483
76	NC_017339	A	6	6	4521	4526	100 %	0 %	0 %	0 %	384551483
77	NC_017339	A	7	7	4589	4595	100 %	0 %	0 %	0 %	384551483
78	NC_017339	ATA	2	6	4673	4678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
79	NC_017339	TAAA	2	8	4694	4701	75 %	25 %	0 %	0 %	384551483
80	NC_017339	ATGA	2	8	4709	4716	50 %	25 %	25 %	0 %	384551483
81	NC_017339	TAT	2	6	4834	4839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551484
82	NC_017339	AACTA	2	10	4851	4860	60 %	20 %	0 %	20 %	384551484
83	NC_017339	TAA	2	6	4976	4981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551484
84	NC_017339	TCG	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551484
85	NC_017339	AAATC	2	10	5023	5032	60 %	20 %	0 %	20 %	384551484
86	NC_017339	AT	3	6	5057	5062	50 %	50 %	0 %	0 %	384551484
87	NC_017339	T	6	6	5142	5147	0 %	100 %	0 %	0 %	384551484
88	NC_017339	AATA	2	8	5166	5173	75 %	25 %	0 %	0 %	384551484
89	NC_017339	TCA	2	6	5191	5196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551484
90	NC_017339	CTA	2	6	5249	5254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551484
91	NC_017339	AT	3	6	5266	5271	50 %	50 %	0 %	0 %	384551484
92	NC_017339	ACA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551484
93	NC_017339	TA	3	6	5363	5368	50 %	50 %	0 %	0 %	384551484
94	NC_017339	GTTT	2	8	5386	5393	0 %	75 %	25 %	0 %	384551484
95	NC_017339	CTG	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551484
96	NC_017339	G	6	6	6466	6471	0 %	0 %	100 %	0 %	384551485
97	NC_017339	ATA	3	9	6519	6527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551485
98	NC_017339	TGA	2	6	6672	6677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551485
99	NC_017339	GA	3	6	6676	6681	50 %	0 %	50 %	0 %	384551485
100	NC_017339	TAA	2	6	6709	6714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551485
101	NC_017339	ATT	2	6	6749	6754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551485
102	NC_017339	TCA	2	6	6834	6839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551485
103	NC_017339	T	6	6	7034	7039	0 %	100 %	0 %	0 %	384551485
104	NC_017339	TTAG	2	8	7059	7066	25 %	50 %	25 %	0 %	384551485
105	NC_017339	TCC	2	6	7096	7101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384551486
106	NC_017339	TTG	2	6	7124	7129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551486
107	NC_017339	TAAG	2	8	7193	7200	50 %	25 %	25 %	0 %	384551486
108	NC_017339	TGC	2	6	7257	7262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551486
109	NC_017339	GAA	2	6	7276	7281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551486
110	NC_017339	AAATT	2	10	7289	7298	60 %	40 %	0 %	0 %	384551486
111	NC_017339	TGC	2	6	7317	7322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551486
112	NC_017339	ATA	2	6	7334	7339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551486
113	NC_017339	TCT	2	6	7378	7383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551486
114	NC_017339	TCGT	2	8	7404	7411	0 %	50 %	25 %	25 %	384551486
115	NC_017339	TCC	2	6	7438	7443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384551486
116	NC_017339	ATCT	2	8	7457	7464	25 %	50 %	0 %	25 %	384551486
117	NC_017339	ACA	2	6	7474	7479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551486
118	NC_017339	TCC	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384551486
119	NC_017339	TAAATT	2	12	7602	7613	50 %	50 %	0 %	0 %	384551486
120	NC_017339	TTC	2	6	7952	7957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551487
121	NC_017339	TTC	2	6	7976	7981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551487
122	NC_017339	TTA	2	6	8031	8036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551487
123	NC_017339	TCT	2	6	8070	8075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551487
124	NC_017339	TGA	2	6	8084	8089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551487
125	NC_017339	AAAT	2	8	8094	8101	75 %	25 %	0 %	0 %	384551487
126	NC_017339	T	6	6	8132	8137	0 %	100 %	0 %	0 %	384551487
127	NC_017339	CTT	2	6	8179	8184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551487
128	NC_017339	T	6	6	8228	8233	0 %	100 %	0 %	0 %	384551487
129	NC_017339	ATATT	2	10	8239	8248	40 %	60 %	0 %	0 %	384551487
130	NC_017339	T	6	6	8321	8326	0 %	100 %	0 %	0 %	384551488
131	NC_017339	TTA	2	6	8330	8335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
132	NC_017339	ATA	2	6	8385	8390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
133	NC_017339	ACC	2	6	8423	8428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384551488
134	NC_017339	ATT	2	6	8430	8435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
135	NC_017339	TACCTG	2	12	8453	8464	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384551488
136	NC_017339	AAT	2	6	8503	8508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
137	NC_017339	GAA	2	6	8509	8514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551488
138	NC_017339	T	6	6	8532	8537	0 %	100 %	0 %	0 %	384551488
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.